在風雲第三部中最重要的篇章就是千秋大劫篇，可以說整部漫畫的起源就是為瞭平息這場劫難，但千秋大劫到底是什麼，由誰預知，由誰佈局，由誰平息的，為瞭這場劫難，武林中人又做瞭什麼來應對千秋大劫呢？
大劍師
大劍師是漫畫中最先預見千秋大劫的，他對大劫的描述如下：這場千秋大劫，將有一個形如半月。以太陽為徽號的島國引起而此島國就是來對中原虎視眈眈的東瀛！隻要東瀛勢力如旭日萬升，屆時，神州將大難臨頭，千千萬萬的無辜生靈勢必受到屠殺。
為結束劫難，大劍師鍛造瞭一把”劍“，此劍劍身內外的青銅是石質，必須經過千百年後，方可成劍。乃是為千百年後的英雄所造。大劍師有感英雄劍寂寞，便多鑄一柄，插在其畔，所以英雄劍原有兩柄。並在其中註入莫名劍訣劍意。更預言，與英雄劍人劍匹配的人，更是一柄天生的劍——天劍。而這兩把劍千百年後的主人就是武林神話無名和他的師兄，慕應雄。
僧皇
笑三笑雖然身居龍龜精元，不死不滅，但他本身沒有預知未來的能力。之所以他知道千秋大劫，完全是因為上一代武林神話僧皇。僧皇是當時佛傢最高領袖，有著絕世的武功，更不可思議的是擁有預知未來的能力。在僧皇的預言中不久的將來，將有一場禍及全天下的大劫難，他把這個預言告訴瞭笑三笑，為瞭阻止這場禍亂，僧皇放棄瞭得道成佛的機會，將自己額頭上的“照心鏡：在臨死前留給瞭笑三笑。笑三笑從他那裡繼承瞭照心鏡，並通過照心鏡預知未來一角，為防止千秋大劫而努力籌劃著。
笑三笑
笑三笑在千年之前得到龍龜精元，不死不滅。得到上天眷顧的他也背負起守護天地正道的使命。在笑三笑得到照心鏡之後，寧願消耗自己的壽命使用照心鏡也要為未來的天下化解這份危難。在多年的奔走間，笑三笑忽略瞭傢人的感受，妻子到死也沒有見他一面，兩個兒子也因笑三笑不顧傢庭親人而投入魔道，成為千秋大劫的推動者。
大魔神、大當傢
大魔神原名笑驚天，是笑三笑的長子。大魔神初登場於風雲漫畫第三部635回出現，身材魁梧，因為其弟大當傢之徒隱劍流門主隼人天隱不甘永遠屈於大當傢之下，聯合聶風和步驚雲密謀反叛讓大當傢傷痕累累走投無路之際，神一般擋路於眾人之前，所以在一招混天四絕之蟄雷拳勢將隱劍流一幹人等叛徒輕易斬殺。在連城志鑄成無情刀後，於眾人聯手，在白天大魔神散功之時殺掉大魔神。一身精元全部被連城志所吸收。
大當傢是神人笑三笑的次子，隱劍流背後的幕後掌權，宣化號大當傢。東瀛絕頂高手隼人天隱的師父，亦是隼人天隱最恨的仇人。與大魔神笑驚天兄弟二人，因一直對父親笑三笑心懷忌恨，遂以順應天命為由，暗中致力推動千秋大劫。身懷其父所創萬道森羅絕學，能掌控人心。但最終卻落得雙腿殘廢的結局，最終被七當傢手起刀落，身首異處。
連城志
連城志是千秋大劫的應劫之人。其人貌恭良而內狡詐，狀溫情而實涼薄。他本身是中原孤兒，幼時賣身葬父，而不失尊嚴，被日本天皇心腹松本崗看中，請神醫雕刻皇者之骨，代替已經死去的天皇之子，作為天皇之子被步驚雲帶回日本。在少年時他直言神州苦難無數，唯有一統中土東瀛，才能真正解救蒼生。從這可以看出連城志從小野心勃勃。
在步驚雲遇到他前，隻是一個不懂武功的平凡人，為躲避隱劍流的追殺，步驚雲開始傳授他無求易決。連城志天賦異稟，不多久便學會這門無上神功，但心思深沉的他卻隱瞞瞭這一點。隨後連城志在無天煉獄中趁赤雪昏迷，奸淫瞭赤雪，欺騙赤雪感情，學得無天煉獄神功赤火神功以及神奪七空。
在經歷一系列江湖爭鬥後，連城志練成絕世神功，並與赤雪隱居世外，但不料想為促成千秋大劫的到來，重八弒殺赤雪嫁禍於步驚雲，連城志怒火焚心，跳入火鼎之中，終於浴火重生，成為“九轉重生”的赤火神功最高境界。隨後在步驚雲之父步淵亭幫助下煉成無情刀，並斬殺大魔神吸收其畢生功力成為神州東瀛第一人。連武林神話無名也說：”我們畢生所遇最強的恐怖強敵，人間最匪夷所思的絕世強者“
為阻止連城志屠殺中原武林，風雲與其約戰樂山大佛！決戰之期無名領引中原武林將其“戰意”註入“英雄劍”之中，風雲以“英雄劍”之力，得以與連城志抗衡；然而眾人凝神時刻，與連城志合謀已久的大當傢突然出現，以“萬道森羅”控制無名之心，讓其倒戈皇帝！小武及時現身，擊退大當傢。“英雄劍”因為大當傢的出現，被連城志破解，然而小武再次出現，傳風雲二人“龍兒與連城志一戰戰事”——原來龍兒以身試戰，找出連城志弱點，風雲受龍兒犧牲感召，終於擊敗連城志。
連城志戰敗之時，施襲小武，然而連城志已是強弩之末，被小武所擒，連城志憤恨不平，催動“赤火神功”，導致烈火攻心，引火自焚。自此千秋大劫到一段落。
步驚雲
如果說連城志是是千秋大劫的應劫之人，那步驚雲就是千秋大劫的解劫之人。（畢竟步驚雲傳的主角）。在笑三笑的預言中，千秋不滅，大劫無情有三個應劫之人：第一個便是東瀛天皇——連城志，第二個是不哭死神——步驚雲，第三個則是大魔神——笑驚天。步驚雲為報其子步天之仇，追殺隱居的連城志，但最終被重八嫁禍，反而推動瞭千秋大劫的到來。
連城志鑄成無情後，暗算殺死大魔神，並吸收其混元四絕的四顆精元。步驚雲現身力戰連城志，但絕世好劍被無情斬斷，步驚雲也因連城志功力大增在戰鬥中落入下風，隨後被七當傢救走。連城志下挑戰書，單挑風雲二人，步驚雲最後關頭趕到樂山大佛與聶風聯手對戰連城志，最後以劍聖龍兒所留遺書指點，加上步淵亭書信以及小武的出現，讓連城志心神大亂，最後步驚雲以麒麟臂引發連城志心火反噬、自焚而亡。
結局
雖然連城志被風雲合力擊殺，但千秋大劫的劫心未滅。劫心轉移到聶風之孫、邪王易風之子天涯身上。為保故人之後，風雲力戰逆劍四祖及小武，最後時刻從步淵亭手中救下天涯。步驚雲返回驚雲道重掌武林，聶風則與兒媳晴怡、孫子聶天涯歸隱。數年之後天涯在愛寵被蟒蛇襲擊致死而激起手背千秋大劫之印。